Ну есть мнение, что замачивание не только способствует ускорению приготовления, но также позволяет вывести "вещества", вызывающие брожения в желудки и сопутствующие немелодичные звуки. И если это так, то логично от этих "веществ" избавиться, слив воду. Я не спец в этих вопросах, но на всякий случай воду сливаю, тем более что не сложно новую залить :)
Суп из лимской фасоли